mrbayes都方法(用mrbayes进行形态数据分析用什么模型)

1.用mrbayes进行形态数据分析用什么模型

简单步骤 1 序列的比对，然后将比对好的序列转化成.nex格式 2 运行MrBayes，简单步骤如下：（依次输入命令，完成简单也最常用的分 析）：Execute filename.nex，打开待分析文件，文件必须和mrbayes程序在同一目录下。Lset nst=6 rates=invgamma。

Modem，其实是Modulator（调制器）与Demodulator（解调器）的简称，中文称为调制解调器（港台称之为数据机）。跟据Modem的谐音，亲昵地称之为“猫”。 工作原理计算机内的信息是由“0”和“1”组成数字信号，而在电话线上传递的却只能是模拟电信号。于。

成本性态也称为成本习性，指在一定条件下成本总额的变动与特定业务量之间的依存关系。这里的业务量可以是生产或销售的产品数量，也可以是反映生产工作量的直接人工小时数或机器工作小时数。 成本按习性可划分为固定成本、变动成本和混合成本三类。

当花分生组织分化完成后，开始进行花器官原基的分化，科学家们目前已经克隆了拟南芥和金鱼草中控制花器官分化的基因，并据此提出了ABC模型学说。 通过遗传分析发现调控花器官形成的基因按功能可以划分为ABC三组，每一组基因均在相邻的花器官中发。

（将不同图层的几何形态和属性组合而创建输出图层）、距离量算（计算空间要素之间的。2.栅格数据模型与矢量数据模型相比的优缺点：更容易进行数据的操作、集合和分析。

（第3组 宏现经济增长与发展，6686个字符） 中国能源、环境与经济增长基于面板数据的计量分析 王洲洋 （河北经贸大学数统学院，石家庄，050061） 摘 要 本文运用面板数据的分析方法对我国各地区的能源消费、环境污染与经济增长进行了实证研究。研..

2.如何使用mrbayes构建分子进化树

简单步骤 1 序列的比对，然后将比对好的序列转化成.nex格式 2 运行MrBayes，简单步骤如下：（依次输入命令，完成简单也最常用的分 析）：Execute filename.nex，打开待分析文件，文件必须和mrbayes程序在同一目录下。

Lset nst=6 rates=invgamma，该命令设置进化模型为with gamma-distributed rate variation across sites和a proportion of invariable sites的GTR模型。模型可根据需要更改，不过一般无须更改。

3 mcmc ngen=10000 samplefreq=10，保证在后面的可能性分布中probability distribution至少取到1000个样品。默认取样频率：every 100th generation。

4 如果分裂频率分支频率split frequencies的标准偏差standard deviation在100,000代generations以后低于0.01，当程序询问：“Continue the analysis? (yes/no)”，回答no；如果高于0.01,yes继续直到该值低于0.01。 5 sump burnin=250（在此为1000个样品，即任何相当于你取样的25%的值），参数总结summarize the parameter，程序会输出一个关于样品（sample）的替代模型参数的总结表，包括mean,mode和95 % credibility interval of each parameter，要保证所有参数PSRF(the potential scale reduction factor)的值接近1.0，如果不接近，分析时间要延长。

6 sumt burnin=250，总结树summarize tree。程序会输出一个具有每一个分支的posterior probabilities的树以及一个具有平均枝长mean branch lengths的树。

这些树会被保存在一个可以由treeview等读取的树文件中。

3.用mrbayes进行形态数据分析用什么模型

简单步骤 1 序列的比对，然后将比对好的序列转化成.nex格式 2 运行MrBayes，简单步骤如下：（依次输入命令，完成简单也最常用的分 析）：Execute filename.nex，打开待分析文件，文件必须和mrbayes程序在同一目录下。

Lset nst=6 rates=invgamma。Modem，其实是Modulator（调制器）与Demodulator（解调器）的简称，中文称为调制解调器（港台称之为数据机）。

跟据Modem的谐音，亲昵地称之为“猫”。 工作原理计算机内的信息是由“0”和“1”组成数字信号，而在电话线上传递的却只能是模拟电信号。

于。成本性态也称为成本习性，指在一定条件下成本总额的变动与特定业务量之间的依存关系。

这里的业务量可以是生产或销售的产品数量，也可以是反映生产工作量的直接人工小时数或机器工作小时数。 成本按习性可划分为固定成本、变动成本和混合成本三类。

当花分生组织分化完成后，开始进行花器官原基的分化，科学家们目前已经克隆了拟南芥和金鱼草中控制花器官分化的基因，并据此提出了ABC模型学说。 通过遗传分析发现调控花器官形成的基因按功能可以划分为ABC三组，每一组基因均在相邻的花器官中发。

（将不同图层的几何形态和属性组合而创建输出图层）、距离量算（计算空间要素之间的。2.栅格数据模型与矢量数据模型相比的优缺点：更容易进行数据的操作、集合和分析。

（第3组 宏现经济增长与发展，6686个字符） 中国能源、环境与经济增长基于面板数据的计量分析 王洲洋 （河北经贸大学数统学院，石家庄，050061） 摘 要 本文运用面板数据的分析方法对我国各地区的能源消费、环境污染与经济增长进行了实证研究。

研。..。

4.求助,第一次用MrBayes算进化树的问题

简单步骤

1 序列的比对，然后将比对好的序列转化成.nex格式

2 运行MrBayes，简单步骤如下：（依次输入命令，完成简单也最常用的分

析）：Execute filename.nex，打开待分析文件，文件必须和mrbayes程序在同一目录下。Lset nst=6 rates=invgamma，该命令设置进化模型为with gamma-distributed rate variation across sites和a proportion of invariable sites的GTR模型。模型可根据需要更改，不过一般无须更改。

3 mcmc ngen=10000 samplefreq=10，保证在后面的可能性分布中probability distribution至少取到1000个样品。默认取样频率：every 100th generation。

4 如果分裂频率分支频率split frequencies的标准偏差standard deviation在100,000代generations以后低于0.01，当程序询问：“Continue the analysis? (yes/no)”，回答no；如果高于0.01,yes继续直到该值低于0.01。

5 sump burnin=250（在此为1000个样品，即任何相当于你取样的25%的值），参数总结summarize the parameter，程序会输出一个关于样品（sample）的替代模型参数的总结表，包括mean,mode和95 % credibility interval of each parameter，要保证所有参数PSRF(the potential scale reduction factor)的值接近1.0，如果不接近，分析时间要延长。

6 sumt burnin=250，总结树summarize tree。程序会输出一个具有每一个分支的posterior probabilities的树以及一个具有平均枝长mean branch lengths的树。这些树会被保存在一个可以由treeview等读取的树文件中。

5.偿债能力分析方法有哪些

偿债能力分析（长期、短期）：

1）资产负债率（负债比率）=企业负债总额/企业资产总额

考察企业长期债务趋势，是反映长期偿债能力的晴雨表

2）所有者权益负债率（负债权益比率）=负债总额/所有者权益

反映债权人和所有者提供资金的比例，反映经营资金是否靠举债取得

3）现金流入量对负债总额比率=销售收入（或营运资金）/负债总额

它和流动比率、速动比率指标结合全面判断企业偿债能力大小

4）产权比率=负债总额/所有者权益

考察企业自有资本的偿债能力

5）流动比率=流动资产合计/流动负债合计

考察企业资产流动性，表明企业短期偿债能力

6）速动比率（酸性试验比率）=速动资产合计/流动负债合计

判定企业短期偿债能力的重要指标

7）企业血压=（动负债合计-速动资产合计）/流动负债合计

表明企业支付流动负债的缺口有多大

8）货币资金比率=货币资金合计/流动负债合计

反映货币资金占流动负债比重，比值越大，表明偿债能力越强

9）基础防卫期间=速动资产/每日营业固定支出

反映无任何收入情况下，现有速动资产能以支付的天数

10）营运资金与流动负债比率=流动负债/（流动资产-流动负债）

考察企业一定时期营运资金负担企业债务的情况

11）即付比率=（现金+银行存款）/（流动负债-预收款项-预提费用-远期借款）

反映企业一定时期用货币资金支付流动负债的能力大小

12）有形净值债务率=负债总额/（所有者权益-无形资产）

考察企业有形净资产支付债务的能力

13）固定资产与所有者权益比率=固定资产净值/所有者权益

考察企业购建固定资产的资金由所有者提供的情况

14）已获利息倍数=税前利息/支付利息额

考察企业一定盈利水平下支付债务利息的能力，反映利息的保障倍数

6.贝叶斯都有什么统计学贡献丫

贝叶斯（1702-1763） Thomas Bayes，英国数学家.1702年出生于伦敦，做过神甫。1742年成为英国皇家学会会员。1763年4月7日逝世。贝叶斯在数学方面主要研究概率论。他首先将归纳推理法用于概率论基础理论，并创立了贝叶斯统计理论，对于统计决策函数、统计推断、统计的估算等做出了贡献.1763年发表了这方面的论著，对于现代概率论和数理统计都有很重要的作用。贝叶斯的另一著作《机会的学说概论》发表于1758年。贝叶斯所采用的许多术语被沿用至今。

贝叶斯决策理论是主观贝叶斯派归纳理论的重要组成部分。

贝叶斯决策就是在不完全情报下，对部分未知的状态用主观概率估计，然后用贝叶斯公式对发生概率进行修正，最后再利用期望值和修正概率做出最优决策。

贝叶斯决策理论方法是统计模型决策中的一个基本方法，其基本思想是：

1、已知类条件概率密度参数表达式和先验概率。

2、利用贝叶斯公式转换成后验概率。

3、根据后验概率大小进行决策分类。

他对统计推理的主要贡献是使用了"逆概率"这个概念，并把它作为一种普遍的推理方法提出来。贝叶斯定理原本是概率论中的一个定理，这一定理可用一个数学公式来表达，这个公式就是著名的贝叶斯公式。 贝叶斯公式是他在1763年提出来的：

假定B1,B2，……是某个过程的若干可能的前提，则P(Bi)是人们事先对各前提条件出现可能性大小的估计，称之为先验概率。如果这个过程得到了一个结果A，那么贝叶斯公式提供了我们根据A的出现而对前提条件做出新评价的方法。P(Bi∣A)既是对以A为前提下Bi的出现概率的重新认识，称 P(Bi∣A)为后验概率。经过多年的发展与完善，贝叶斯公式以及由此发展起来的一整套理论与方法，已经成为概率统计中的一个冠以“贝叶斯”名字的学派，在自然科学及国民经济的许多领域中有着广泛应用。

7.流速测量都有哪些方法

流速测量方法

1、浮标法

浮标法是河流测速中很常用，简单易行的一种方法。在河流测速中，在上游的某一位置放置漂浮物，同时用秒表记下当时的时间，当漂浮物到达下游某一位置时记录时间，同时测出这两个位置的距离，就可以算出河水的流速，重复几次就可以求出河水的平均流速。但是这种方法只能测出流体的表面流速。在坡面流测速中，我们也可以用此种方法，漂浮物可以选用较为小的诸如泡沫颗粒一类的东西。两点间的距离应该是径流流过的距离。重复几次，即可确定水流速度的平均值。此种方法简单易行，不足之处就是误差较大。用公式表示为：

2、颜色示踪法

颜色示踪法也是河流测流速的一种方法。通过给流体注入染色剂，如红墨水，在初始位置倒入染色剂并记录时间，选定某一位置作为中止位置，当染色后的流体到达时记录时间，就可以求出水流流速。多做几个重复，就可以求出此段距离内的平均流速。这种方法同样简便易行，误差较浮标法小，但要注意距离不能选得太长，否则染色剂会稀释严重，肉眼不易观察。计算公式和浮标法相同

3、盐液示踪法

盐液示踪法是在上游某一位置给径流中注入盐液，同时用秒表记录时间，通过布设在下游的电极来感应盐液的到达，由连接在电极上的灵敏电流计显示出来。通过时间差和距离，就可以算出此段距离内的流体速度。

计算公式和上式相同，只不过时间 为从开始注入染色剂到电流计的指针发生明显偏移的时间。

4、流量法

在明渠水流测量过程中，对于非常规则的渠道，流量法是目前测量流速比较准确的方法之一，其原理明确、简单。对于坡面薄层水流，由于水流深度在厘米级，其误差主要是产生于水层厚度的测量。在不同坡度和泥沙含量条件下，测量水流流量与水深，流量用积分桶测量，水深用水位计测量，水位计的精度为1/10mm。可以用公式表示为：

5、电解质脉冲法

这是一种较新的测速方法。在示踪法的基础上，假设加入的盐液为电解质脉冲，建立盐液在水流中迁移的数学模型，并求得解析解，再根据测量结果拟合出水流速度，这种方法即为电解质脉冲法。该方法从理论和初步测量结果来看是可行的，但其可行性还需要用大量的实验进行验证，分析泥沙含量、流速和流量对测量结果的影响。由于在野外或室内不规范的条件下，至今没有一种好的方法对薄层水流流速进行比较准确的测量，因此只有在室内设置规范的模拟水槽，建立盐液在水流中迁移的数学模型，并求得解析解，经模数转换后用最小二乘法对电解质迁移的数学模型进行拟合，计算出水流速度。同时，用质心运动速度和流量法的测量结果对这种方法进行验证。

8.感统训练都有哪些方法方式

1、感统失调症状比较明显的，就是要进行训练纠正了，3-6岁效果比较明显，7-12岁纠正时间较长，12岁以上效果比较一般；

2、普通正常孩子，感统训练可以提高和改善孩子的学习成绩、逻辑推理能力、记忆能力、运动协调能力、人际关系、饮食和睡眠、情绪等。

【前庭平衡失调】多动不安，注意力不集中，上课不专心，爱做小动作，调皮任性，容易违反课堂纪律，很难与别人分享玩具和食物、语言发展迟缓、语言表达困难等。

【大陀螺训练】儿童坐在大陀螺内，由指导者在一旁帮助其旋转。速度不宜太快，约2~3秒转一圈为宜。可先向左回转，稍做停顿后再向右回转，也可连续左回转几次，再连续往右回转几次。回转的速度也可适当变换。

【训练时间】开始时为每次10~15圈，以后慢慢增加到每次20~300圈，根据情况而定，每周2次。

【注意事项】首次旋转时间要注意，如儿童出现不适要将旋转速度减慢或停下来。另外还要注意女孩子的长发要束起，以免旋转时压住头发。

9.声速的测量的常用方法有哪些

声速测量的方法

一、传统方法

方法1：一个声音产生后，并不会立刻传到你的耳朵，通常要经过一段时间。例如：如果你参加一个运动会，坐在离鸣枪的人有一段距离的地方，你会先看到枪冒烟，后听到枪声。这是因为光行进的速度非常快，而声音的速度就慢得多。所以你会立刻看到枪冒烟，但声音要过一会儿之后才会听到。于是早期测量声音的速度是利用枪来做实验。帮忙的人要拿着枪在一个量好的距离外，另一个人就拿着马表站在原点。在看到信号之后，帮忙的人就对空鸣枪。在原点的人一看到枪的火花和烟时，就把马表按下来；而当他听到枪声时，就再按一次马表让马表停下来。看到火花和听到枪声之间的时间，就是声音行经这一段量好距离所需的时间。就能算出声音的速度。根据这一原理你不妨在今后的校运动会的时候试验一下（利用百米赛跑就可以了）。为了测量声音的速度你需要一个马表和一个皮尺。量一个500公尺的距离，要尽可能量得准确一点。你和你的同学分别站在两端；你的同学两手各拿一块大石头，你则拿一个马表。当你大叫“开始”时，你的同学要把石头举到头顶，尽量大声敲击。ؤ当你一看到石头撞在一起，就按下马表。等到你听到石头撞击的音，就再按一下马表让马表停下来。时间方面要记录到十分之一秒。如果能多做几次实验，算出时间的平均值是最好的。ؤ你只要用计算机把你和你同学的距离除以时间，就可以算出声音的速度了。

方法2：测量声音的速度还有一种利用回音来测量的方法：所谓回声，就是声音在传播的过程中碰到高大的障碍物被反射了回来，那么我们就可以根据这样的原理，站在离高墙较远的地方（事先测出你到高墙的距离）大声地喊一下，在你喊的同时按下秒表，当你听到自己的回声再按一下秒表，这样一来，你的喊声从你那儿到高墙打了一个来回，你只要把上面说的你跟高墙的距离除以测得的时间的一半，这声音的速度也就出来了（这里要注意的是因为人能分辨出自己的回声的时间间隔要超过0.1秒，声音有传播速度是340米每秒，所以你与墙的距离，至少不得少于17米才行，而且中间还不能有障碍物）。

二、现代大学实验室中测量方法

测量声速最简单、最有效的方法之一是利用声速v 、振动频率f和波长λ之间的基本关系，即实验时用结构相同的一对（发射器和接收器）超声压电陶瓷换能器，来作声压与电压之间的转换。利用示波器观察超声波的振幅和相位，用振幅法和相位法测定波长，由示波器直接读出频率f。

方法1：：共振干涉法

由发射器发出的声波近似于平面波。经接收器反射后，波将在压电陶瓷换能器的两端面间来回反射并且叠加。当两个换能器之间的距离等于半波长的整数倍时发生共振，产生共振驻波现象，波幅达到极大。由纵波的性质可以证明，振动位移处于波节时，则声压是处于波腹。接收器端面近似为一波节，接收到的声压最大，经接收器转换成的电信号也最强。声压变化和接收器位置的关系可从实验中测出，当接收器端面移动到某个共振位置时，示波器上会出现最强的电信号，如果继续移动接收器，将再次出现最强的电信号，两次共振位置之间的距离即为1/2λ 。

方法2：相位比较法

波是振动状态的传播，也可以说是相位的传播。沿传播方向上的任何两点，其振动状态相同，或者说其相位差为2π的整数倍时两点间的距离应等于波长λ的整数倍，利用这个公式可测量波长。由于发射器发出的是近似于平面波的超声波，当接收器端面垂直于波的传播方向时，其端面上各点都具有相同的相位。沿传播方向移动接收器时，总可以找到一个位置使得接收到的信号与发射的信号同相。移过的这段距离必然等于超声波的波长λ 。为了判断相位差并且测定波长，可以利用双踪示波器直接比较发射的信号和接收的信号，同时沿传播方向移动接收器寻找同相点。也可以利用利萨如图形寻找同相时椭圆退化为斜直线的点。

方法3：时差法

即用比传统方法更精确的仪器测出声波传播一定距离所用的时间，然后根据公式V=L/t即可测出声速。